Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms