Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zfp988F6VKC7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zfp988F6VKC7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Zfp988F6VKC7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Zfp988F6VKC7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Zfp988F6VKC7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Zfp988F6VKC7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Zfp988F6VKC7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Zfp988F6VKC7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zfp988F6VKC7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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