Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17555F6U8B9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms