Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21977F6U3N7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms