Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms