Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC067074F6RXI4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BC067074F6RXI4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms