Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm29094F6Q785 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29094F6Q785 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms