Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms