Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms