Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20518E9Q548 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms