Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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