Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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ApobE9Q414 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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ApobE9Q414 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ApobE9Q414 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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