Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms