Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp558E9Q1J0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Zfp558E9Q1J0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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