Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms