Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms