Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms