Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms