Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ddx60E9PZQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Ddx60E9PZQ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Ddx60E9PZQ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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Ddx60E9PZQ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Ddx60E9PZQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ddx60E9PZQ1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms