Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms