Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms