Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms