Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms