Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm3298E9PW80 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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