Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm3002E9PW72 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms