Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9008E9PVG0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms