Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
AU019823E9PUQ3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AU019823E9PUQ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms