Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms