Protein–RNA interactions for Protein: E0CXA2

Gm45711, CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45711E0CXA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45711E0CXA2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45711E0CXA2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms