Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rdh8D3Z6W3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms