Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hfm1D3Z4R1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms