Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim12cD3Z3L3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms