Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms