Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm6685D3YYP3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6685D3YYP3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms