Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc170D3YXL0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms