Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SafbD3YXK2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms