Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn24D3YXJ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn24D3YXJ9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms