Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rexo5D3YW29 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rexo5D3YW29 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms