Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms