Protein–RNA interactions for Protein: D0VYS2

Hsf3, Heat shock factor protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf3D0VYS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf3D0VYS2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf3D0VYS2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf3D0VYS2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf3D0VYS2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf3D0VYS2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hsf3D0VYS2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsf3D0VYS2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms