Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Catsperg2C6KI89 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms