Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm6133B2RY53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm6133B2RY53 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms