Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cped1B2RX70 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms