Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah3B2RWG3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms