Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc8B2RUS7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc8B2RUS7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc8B2RUS7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms