Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zscan5bB2RTN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms