Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a28B2RT89 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms