Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brpf1B2RRD7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brpf1B2RRD7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms