Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud3B1AZ99 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud3B1AZ99 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms