Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssxb8B1AY40 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ssxb8B1AY40 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssxb8B1AY40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssxb8B1AY40 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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